全基因组重测序

技术简介

全外显子组测序(Whole Exome Sequencing,WES)是对整个基因组的全部基因编码区进行测序。人类基因组大小约 3G 个碱基,而基因编码区只占 1 -2%,大约 30M 个碱基。而编码区出现的变异往往会导致严重的后果,是大多数遗传病或肿瘤发生的直接原因。因此,对外显子区域进行测序是最为经济有效的方法之一。

技术原理

仪器平台

全基因组重测序可以检测单核苷酸多态性(SNP)、插入缺失(InDel)、拷贝数变异(CNV)、染色体结构变异(SV)等,发现 DNA 变异与某一表型(例如某种疾病)之间的联系。由于不需要重新从头拼接,因此仅需要相对较小的数据量,通过基因组比对(Mapping)的方式得到个体序列变化的信息。随着测序成本的降低和分析技术的成熟,目前全基因组重测序在人类和动植物遗传学研究中已有广泛应用。

项目流程

样本要求

样本类型:DNA、组织、细胞、全血等;

DNA 总量:DNA≥ 2 μg;浓度:DNA≥ 50 ng/μl;要求主带清晰,无降解,浓度大于 50ng/ul,总量大于 1ug,OD260/OD280 =1.8~2.0,OD260/OD230=1.5 ~2.2。

测序深度:≥100X; 测序读长:2*150bp。