RNA 甲基化测序(MeRIP-seq)

技术简介

M6A 是一种常见的 RNA 甲基化修饰方式,研究表明它在调控基因表达、剪接、RNA 编辑、RNA 稳定性、控制 mRNA 寿命和降解、介导环状 RNA 翻译等方面扮演重要角色。粒成生物新开发微量 MeRIP-seq 技术,利用新的去 rRNA 技术,可以同时检测 mRNA, lncRNA 及 circRNA 甲基化修饰图谱,帮助研究人员对 RNA 转录后甲基化修饰图谱进行全面研究,是表观转录组研究的关键技术。值得关注的是微量 MeRIP-seq 技术通过技术优化,大幅降低 MeRIP 的样本起始要求量,仅 1 -20μg 总 RNA 即可满足实验要求。

技术原理

技术应用

肿瘤异质性: 揭示癌细胞的 RNA 甲基化图谱;

细胞分化: 绘制细胞分化调控表观图谱;

免疫微环境: 免疫细胞激化、分化等过程的表观调控机制;

神经科学: 探究神经相关疾病的分子机制。

优势

肿瘤异质性: 揭示癌细胞的 RNA 甲基化图谱;

细胞分化: 绘制细胞分化调控表观图谱;

免疫微环境: 免疫细胞激化、分化等过程的表观调控机制;

神经科学: 探究神经相关疾病的分子机制。

样本要求

物种信息:人、大鼠、小鼠

样本要求:组织质量为 10-20mg

细胞数量为 5×106~107

测序模式:illumina Hiseq PE150

推荐数据量:≥6Gb/ 样本

数据分析