技术简介
Illumina Infinium MethylationEPIC BeadChip 芯片(850K 芯片),为研究者提供了一个可靠且经济高效的甲基化分析平台。并为 FFPE 样本的检测改进了 protocol,以获得更可靠和稳定的结果。广泛应用于干细胞研究、肿瘤和其他复杂疾病研究,是目前适合表观基因组全关联分析研究的全基因组 DNA 甲基化芯片。
850K 芯片可检测人全基因组约 853,307 个 CpG 位点的甲基化状态,其中包含了原 450K 芯片 91% 的位点,并增加了 413,745 个位点。850K 芯片不但保持了对 CpG 岛,基因启动子区的全面覆盖,还特别加强了增强子区(新增了 333,265 个探针覆盖来自 ENCODE 及 FANTOM5 计划的增强子)以及基因编码区的探针覆盖。
【Illumina 甲基化芯片技术参数】
芯片特点
覆盖全面:检测 853,307 个 CpG 位点;全面覆盖 CpG 岛、启动子、编码区及增强子;
无需“甲基化 DNA 免疫共沉淀”,亚硫酸氢盐处理基因组 DNA 即可进行芯片实验;Infinium 探针设计,直接识别甲基化位点;
技术重复重现率 >98%;
操作简单,无须 PCR 扩增;模板量可低至 250ng;
适用于 FFPE 样品。
技术特点
流程简单,无需进行繁琐的免疫共沉淀;
单碱基分辨率;
通量高,可一次性检测 8 个以上样品;
全基因组覆盖,对于未知功能区域及增强子同样覆盖;
只针对人类样本;
数据准确,与焦磷酸平台吻合度高。
优势
成熟的服务平台:稳定而系统的芯片实验全面解决方案,可为客户提供总 RNA 抽提、样品质检、RNA 标记、杂交、洗脱、图像扫描、数据分析等一系列服务。
专业的实验人员:从 RNA 抽提到芯片杂交均配备有专业的实验人员,具有丰富的芯片实验操作经验,遵循严格的质控标准,层层把关确保高质量完成实验。
强大的分析团队:实战经验丰富的分析团队,除能快速完成基础分析外,还能根据客户需求完成个性化分析,提供各类高大上的图表。
稳健的支持团队:一对一服务,为您解决项目全过程中的各类问题,包括但不限于项目方案制定、样本收集、数据结果解读、数据深度挖掘及文章发表支持等。
样本要求
样品类型:组织、细胞、基因组 DNA
样品纯度:OD 260/280 值应在 1.7~2.0 之间; RNA 应该去除干净;不得有其它个体或其它物种的 DNA 污染。
样品浓度:浓度不低于 50ng/μl;
样品总量:每个样品总量不少于 500ng。
样品溶剂:溶解在 TE 中。
样品运输:DNA 低温运输(-20℃);在运输过程中请用 parafilm 将管口密封好,以防出现污染。