全基因组甲基化测序(WGBS)

技术简介

全基因组甲基化测序(WGBS,Whole-genome bisulfite sequencing)结合了亚硫酸氢盐转化方法与新一代高通量测序技术,可在单碱基分辨率水平上高效地检测全基因组 DNA 甲基化状态。亚硫酸氢盐处理可以使 DNA 中未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基转变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变,PCR 扩增所需片段,则尿嘧啶全部转化成胸腺嘧啶。对 PCR 产物进行高通量测序,与参考序列比对,即可判断 CpG/CHG/CHH 位点是否发生甲基化。

技术原理

技术应用

适用任何有参考基因组物种的全基因组甲基化研究,是目前获得 CpG 位点信息最全的技术,特别适用于农林中的小基因组的物种的甲基化图谱挖掘,如拟南芥。

优势

建库质量高,失败率极低,每年五万例左右各种类型样本文库构建经验。

质控过程全程可溯,实时跟踪,反馈及时,确保数据真实可靠。

基础分析丰富,展示形式可个性化定制。

高级分析服务:专业的生物信息分析团队,熟悉各种分析算法和软件;根据客户的需求,提供多种个性化的实现方案。

样本要求

样品纯度:OD 260/280 值应在 1.8~2.0 之间;RNA 应去除干净;(物种不限)

样品浓度:低浓度不低于 50ng/μl;

样品总量:每个样品总量不少于 1μg;

样品溶剂:应溶解在 H20 或 TE (pH 8.0) 中;

样品运输:DNA 低温运输(-20℃);在运输过程中用 parafilm 将管口密封好,以防出现污染。

数据分析